Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srpk2O54781 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srpk2O54781 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms