Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Per1O35973 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Per1O35973 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Per1O35973 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Per1O35973 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Per1O35973 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Per1O35973 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Per1O35973 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Per1O35973 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Per1O35973 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Per1O35973 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Per1O35973 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Per1O35973 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Per1O35973 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Per1O35973 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Per1O35973 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Per1O35973 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Per1O35973 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Per1O35973 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Per1O35973 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Per1O35973 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Per1O35973 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Per1O35973 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Per1O35973 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Per1O35973 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Per1O35973 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Per1O35973 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Per1O35973 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Per1O35973 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Per1O35973 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Per1O35973 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Per1O35973 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Per1O35973 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Per1O35973 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Per1O35973 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Per1O35973 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Per1O35973 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Per1O35973 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Per1O35973 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Per1O35973 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Per1O35973 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Per1O35973 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Per1O35973 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Per1O35973 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Per1O35973 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Per1O35973 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Per1O35973 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Per1O35973 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms