Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bnc1O35914 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bnc1O35914 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bnc1O35914 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms