Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Phox2bO35690 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2bO35690 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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