Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn6O35646 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn6O35646 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn6O35646 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn6O35646 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms