Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edil3O35474 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms