Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc18a3O35304 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc18a3O35304 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms