Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe40O35185 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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