Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ArxO35085 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ArxO35085 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
ArxO35085 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ArxO35085 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ArxO35085 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ArxO35085 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ArxO35085 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ArxO35085 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ArxO35085 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ArxO35085 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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