Protein–RNA interactions for Protein: O09164

Sod3, Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

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Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod3O09164 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sod3O09164 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sod3O09164 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sod3O09164 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sod3O09164 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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