Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms