Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2888K7N746 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm2888K7N746 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm2888K7N746 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm2888K7N746 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm2888K7N746 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm2888K7N746 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm2888K7N746 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm2888K7N746 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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