Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gm379J3QQ19 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gm379J3QQ19 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gm379J3QQ19 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Gm379J3QQ19 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Gm379J3QQ19 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Gm379J3QQ19 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Gm379J3QQ19 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Gm379J3QQ19 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Gm379J3QQ19 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Gm379J3QQ19 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm379J3QQ19 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms