Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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BC024978J3QPC3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BC024978J3QPC3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BC024978J3QPC3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BC024978J3QPC3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BC024978J3QPC3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BC024978J3QPC3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BC024978J3QPC3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC024978J3QPC3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BC024978J3QPC3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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