Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm21060J3KMU4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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