Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms