Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Taf4bG5E8Z2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms