Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H9

Rdh19, MCG134493, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh19G5E8H9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh19G5E8H9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms