Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r34G3XA52 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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