Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna9G3X8Z7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms