Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20517G3UVU6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms