Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
XntrpcF8VQM8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XntrpcF8VQM8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms