Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm28038F7BCN9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms