Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Zfp988F6VKC7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Zfp988F6VKC7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Zfp988F6VKC7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Zfp988F6VKC7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Zfp988F6VKC7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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