Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cald1E9QA15 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cald1E9QA15 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms