Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ccdc7bE9Q9Y3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ccdc7bE9Q9Y3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ccdc7bE9Q9Y3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ccdc7bE9Q9Y3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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