Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm17727E9Q4V7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17727E9Q4V7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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