Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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