Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrp3E9Q1T6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms