Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Ddx60E9PZQ1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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Ddx60E9PZQ1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Ddx60E9PZQ1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx60E9PZQ1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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