Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd1E9PZ26 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms