Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc62E9PVD1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc62E9PVD1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms