Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms