Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb3D3Z6J4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms