Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samd1D3YXK1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd1D3YXK1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms