Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm3259D3YUK0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm3259D3YUK0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm3259D3YUK0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm3259D3YUK0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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