Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms