Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smok3bC0HKC9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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