Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Brpf3B2KF05 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brpf3B2KF05 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms