Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spocd1B1ASB6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms