Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
H2-M5A7VMS3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M5A7VMS3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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