Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm11127A7VMS2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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