Protein–RNA interactions for Protein: A7KBS4

Zscan4d, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4D, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4dA7KBS4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zscan4dA7KBS4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zscan4dA7KBS4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zscan4dA7KBS4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zscan4dA7KBS4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Zscan4dA7KBS4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Zscan4dA7KBS4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Zscan4dA7KBS4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Zscan4dA7KBS4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Zscan4dA7KBS4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Zscan4dA7KBS4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zscan4dA7KBS4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zscan4dA7KBS4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zscan4dA7KBS4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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