Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms