Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Rtf1A2AQ19 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Rtf1A2AQ19 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms