Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttll9A2APC3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttll9A2APC3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms