Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc183A2AJB1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc183A2AJB1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc183A2AJB1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc183A2AJB1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc183A2AJB1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc183A2AJB1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc183A2AJB1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc183A2AJB1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc183A2AJB1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc183A2AJB1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc183A2AJB1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms