Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn34dA2AGU5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms