Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU3

Trdc, T cell receptor delta, constant region (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdcA0A0G2JEU3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms