Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrit3W8DXL4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms